宝应自然资源比较丰富。全县耕地面积90万亩，是全国优质粮棉生产基地县。境内河湖密布，水资源总量共约为1.6亿立方米，水质达到和超过国家Ⅲ类标准。面积较大的湖荡有宝应湖、白马湖、范光湖、射阳湖等，俗称“五湖四荡”，约257.69平方公里。水面滩地面积约73.4万亩，为里下河地区最多的县份。全县野生药用植物305种，总蕴量3560吨。白术、红花、生地、丹参、玄胡、泽泻、薏仁等名贵药材远销省内外。境内栖息着多种野生动物，以野鸡、野鸭、大雁为多。